基于转录组数据挖掘的慢性荨麻疹与创伤后应激障碍的发病关联性分析
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基于转录组数据挖掘的慢性荨麻疹与创伤后应激障碍的发病关联性分析

目的:运用转录组数据挖掘技术探讨慢性荨麻疹(CU)与创伤后应激障碍(PTSD)发病的关联性.方法:在 GEO 数据库中筛选 CU 及 PTSD 数据集中共同的 DEGs;通过 String 11.0 系统构建共同 DEGs 的蛋白质相互作用网络并分析核心基因并进行 GO、KEGG 富集分析;在 TRRUS 数据库查找 DEGs 的转录因子(TF)并绘制 TF 调控网络关系图,分析 CU 与 PTSD 共同的发病机制及发病关联性;通过对观察玉屏风散对 PTSD 模型大鼠行为改善效应 验证 CU 与 PTSD 发病的共同性及关联性。结果:检索出共同的 DEGs 共 106 个,其中核心 DEGs7 个,上调 4 个(TMP4、AGPAT1、TSPAN18、TAB2),下 调 3 个(NETO2、PSMA6、FKBP3)。GO 富集分析显示,相关生物过程主要为缺氧反应等方面,分子功能主要为细胞因子受体结合等方面,细胞组分主要 为细胞质膜、细胞膜微区等方面。KEGG 富集分析结果显示主要通路有:PI3K−Akt、TNF、趋化因子等信号通路。TF 调控网络关系显示 RELA、NFKB1、STAT3 等 42 个转录因子与核心 DEGs 存在显著调控关系。动物实验结果显示玉屏风散对 PTSD 大鼠行为具有明显改善效应。结论:长期精神压力、免疫紊乱及 炎症反应是 CU 与 PTSD 发病的主要共享机制,CU 的免疫性炎性反应与 PTSD 的精神认知紊乱很可能互为因果,故 CU 与 PTSD 具有较强的发病关联性。动 物实验验证了此发病关联性的可能。 【关键词】CU;PTSD;转录组学;发病关联性

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