miR-622 在恶性胸膜间皮瘤细胞中的靶基因预测及生物信息学分析
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miR-622 在恶性胸膜间皮瘤细胞中的靶基因预测及生物信息学分析

目的:通过对 microRNA-622(miR-622)的差异基因及靶基因的预测和筛选,探讨其靶基因在恶性胸膜间皮瘤细胞中所发挥的生物学功 能及参与的信号传导方式。方法:在 NCBI 网站下载人间皮瘤基因数据,利用 GEO2R 对 GES51024 数据集中所下载的恶性间皮瘤组织样本表 达数据做火山图并进行筛选。使用 venn 网站对 miRWalk、miRDB、TargetScan 网站下载的 miR-622 的靶基因数据进行比对交集,并制作 venn 图筛选出交集基因。运用 matescape 进行 GO 富集分析、KEGG 信号通路分析。结果:筛选出了 22 个 miR-622 下游基因(上调 16 个,下调 6 个),通过富集分析发现筛选出的 miR-622 下游基因主要参与肌肉收缩、减数分裂细胞周期、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、细胞对激 素刺激的反应、积极调控细胞成分的生物生成等信号通路。结论:miR-622 在恶性胸膜间皮瘤细胞中的表达与肌肉收缩过程、跨膜受体蛋白 酪氨酸激酶信号传导过程、细胞对激素刺激的反应过程、积极调控细胞成分的生物生成过程、减数分裂细胞周期过程等通路有关。

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